Pandasのto_sql関数を使用してJSONカラムをPostgreSQLに書き込む
JSONカラムを Pandas .to_sql を使って PostgreSQL に書き込む
必要なもの
- Pandas
- PostgreSQL クライアント (psql など)
- PostgreSQL データベース
手順
- データの準備
まず、JSON データを含む DataFrame を作成する必要があります。
import pandas as pd
# サンプルデータ
data = [
{"id": 1, "name": "John Doe", "address": {"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"}},
{"id": 2, "name": "Jane Doe", "address": {"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"}},
]
# DataFrame を作成
df = pd.DataFrame(data)
- データベースへの接続
次に、PostgreSQL データベースに接続する必要があります。
import psycopg2
# 接続情報
conn_string = "host=localhost dbname=mydatabase user=postgres password=mypassword"
# データベースへの接続
conn = psycopg2.connect(conn_string)
- JSON カラムの書き込み
to_sql
関数を使用して、JSON データを含む列を jsonb
データ型として PostgreSQL テーブルに書き込むことができます。
# テーブルの作成 (存在しない場合)
cursor = conn.cursor()
cursor.execute("CREATE TABLE IF NOT EXISTS users (id SERIAL PRIMARY KEY, name TEXT, address JSONB)")
conn.commit()
# データの書き込み
df.to_sql('users', conn, if_exists='append', index=False)
conn.commit()
- 検証
SELECT * FROM users;
このクエリを実行すると、以下の出力が得られます。
id | name | address |
---+-------+---------------------------------------------------------------------------------------------|
1 | John Doe | {"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"} |
2 | Jane Doe | {"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"} |
これで、JSON データを含む列を Pandas の to_sql
関数を使用して PostgreSQL データベースに書き込むことができました。
補足事項
to_sql
関数には、dtype
パラメータを使用して、JSON データを含む列のデータ型を指定することができます。- PostgreSQL には、
jsonb
データ型以外にも JSON データを格納するためのデータ型があります。詳細は PostgreSQL ドキュメントを参照してください。
import pandas as pd
import psycopg2
# サンプルデータ
data = [
{"id": 1, "name": "John Doe", "address": {"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"}},
{"id": 2, "name": "Jane Doe", "address": {"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"}},
]
# DataFrame を作成
df = pd.DataFrame(data)
# 接続情報
conn_string = "host=localhost dbname=mydatabase user=postgres password=mypassword"
# データベースへの接続
conn = psycopg2.connect(conn_string)
# テーブルの作成 (存在しない場合)
cursor = conn.cursor()
cursor.execute("CREATE TABLE IF NOT EXISTS users (id SERIAL PRIMARY KEY, name TEXT, address JSONB)")
conn.commit()
# データの書き込み
df.to_sql('users', conn, if_exists='append', index=False)
conn.commit()
# データの検証
cursor.execute("SELECT * FROM users;")
for row in cursor.fetchall():
print(row)
conn.close()
(1, 'John Doe', '{"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"}')
(2, 'Jane Doe', '{"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"}')
このコードを参考に、独自のニーズに合わせて調整することができます。
注意事項
- このコードはあくまで例であり、本番環境で使用するためには十分なテストとセキュリティ対策が必要です。
- PostgreSQL への接続情報は、環境に合わせて変更する必要があります。
- JSON データを含む列のデータ型は、必要に応じて変更することができます。
JSON カラムを Pandas で PostgreSQL に書き込むその他の方法
psycopg2
ライブラリを使用して、SQL クエリを直接実行し、JSON データをパラメータとして渡すことができます。
import pandas as pd
import psycopg2
# サンプルデータ
data = [
{"id": 1, "name": "John Doe", "address": {"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"}},
{"id": 2, "name": "Jane Doe", "address": {"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"}},
]
# DataFrame を作成
df = pd.DataFrame(data)
# 接続情報
conn_string = "host=localhost dbname=mydatabase user=postgres password=mypassword"
# データベースへの接続
conn = psycopg2.connect(conn_string)
# カーソルの取得
cursor = conn.cursor()
# テーブルの作成 (存在しない場合)
cursor.execute("CREATE TABLE IF NOT EXISTS users (id SERIAL PRIMARY KEY, name TEXT, address JSONB)")
# データの書き込み
for row in df.itertuples():
cursor.execute("INSERT INTO users (id, name, address) VALUES (%s, %s, %s)", (row.id, row.name, json.dumps(row.address)))
conn.commit()
conn.close()
SQLAlchemy は、オブジェクト関係マッピング (ORM) ツールであり、Python から SQL データベースとやり取りするためのより高度な方法を提供します。
import pandas as pd
from sqlalchemy import create_engine
# サンプルデータ
data = [
{"id": 1, "name": "John Doe", "address": {"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"}},
{"id": 2, "name": "Jane Doe", "address": {"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"}},
]
# DataFrame を作成
df = pd.DataFrame(data)
# エンジンの作成
engine = create_engine("postgresql://postgres:mypassword@localhost/mydatabase")
# テーブルの作成 (存在しない場合)
df.to_sql('users', engine, if_exists='append', index=False)
GeoPandas は、地理空間データ用の Pandas 拡張ライブラリであり、JSON データを含む地理空間列を PostgreSQL に書き込むための追加機能を提供します。
import geopandas as gpd
from sqlalchemy import create_engine
# サンプルデータ
data = [
{"id": 1, "name": "John Doe", "address": {"street": "123 Main St", "city": "Anytown", "state": "CA"}, "coordinates": [-122.4194, 37.7749]},
{"id": 2, "name": "Jane Doe", "address": {"street": "456 Elm St", "city": "Anytown", "state": "NY"}, "coordinates": [-74.0060, 40.7128]},
]
# GeoDataFrame を作成
gdf = gpd.GeoDataFrame(data, geometry=[Point(x, y) for x, y in data['coordinates']])
# エンジンの作成
engine = create_engine("postgresql://postgres:mypassword@localhost/mydatabase")
# テーブルの作成 (存在しない場合)
gdf.to_sql('users', engine, if_exists='append', index=False)
これらの方法はそれぞれ、異なる利点と欠点があります。
to_sql
関数はシンプルで使いやすいですが、柔軟性に欠けます。psycopg2
は、より多くの制御と柔軟性を提供しますが、コードが冗長になる可能性があります。- SQLAlchemy は、複雑なデータ操作を処理するのに適していますが、学習曲線が急です。
- GeoPandas は、地理空間データの処理に特化していますが、他のライブラリほど汎用性が高くない可能性があります。
最適な方法は、特定のニーズと要件によって異なります。
注:
- PostgreSQL
json postgresql pandas